以太陽山、月亮山、計劃大山、沙坪溝為核心區(qū)的貴州月亮山自然保護(hù)區(qū)位于貴州省東南部，黔東南州的從江縣、榕江縣和黔南州的三都縣、荔波縣交界處，面積總面積34555.67 hm2。太陽山、月亮山是與雷公山齊名的苗嶺名山，境內(nèi)森林茂密，溝壑縱橫，生境復(fù)雜多樣，植物區(qū)系起源古老。由于偏遠(yuǎn)閉塞，交通極為不便，開發(fā)緩慢，加之人口較少，因此，在以月亮山為主的周邊地區(qū)至今還保留著大面積的原始常綠落葉混交林。林內(nèi)濃蔭蔽日，古木參天，河流、林泉小溪縱橫交錯、分布密集，給生長于其中的眾多植物和動物提供了生息，繁殖場所，現(xiàn)己調(diào)查記錄各類生物約有3000種，珍稀瀕危物種豐富，有國家I級保護(hù)野生動植物5種(植物3種，動物2種)、II級保護(hù)野生動植物49種(植物24種，動物25種)，是天然的生物資源“基因庫”。同時，月亮山區(qū)也是都柳江、漳江的重要發(fā)源地，是從江縣、榕江縣、三都縣、荔波縣水資源的主要供給地，是珠江流域的堅實(shí)的生態(tài)屏障。其森林生態(tài)系統(tǒng)所發(fā)揮的保持水土和涵養(yǎng)水源功能，對保護(hù)下游地區(qū)人民正常的生產(chǎn)生活起著極為重要的作用。因此，對保護(hù)區(qū)內(nèi)現(xiàn)有森林生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行保護(hù)，無論是保護(hù)生物多樣性，還是發(fā)揮其國土保安功能都具有重要意義。
        長期以來，保護(hù)區(qū)內(nèi)原始的森林植被，豐富的生態(tài)系統(tǒng)與生物多樣性就吸引著眾多專家學(xué)者的關(guān)注。1962年，西南綜考隊曾到該林區(qū)作過調(diào)查，認(rèn)為森林植被茂盛，生物資源豐富。1989年，貴州省林業(yè)廳組織了綜合考察團(tuán)，在艱苦條件下，深入月亮山林區(qū)考察。此后，又有眾多專家學(xué)者持續(xù)對月亮山區(qū)進(jìn)行各類調(diào)查。
        黔東南苗族侗族自治州歷屆黨委、政府均重視生態(tài)環(huán)境保護(hù)工作。2003年，自治州政府批準(zhǔn)成立了榕江月亮山州級自然保護(hù)區(qū)和從江月亮山州級自然保護(hù)區(qū)。為進(jìn)一步加強(qiáng)貴州月亮山自然保護(hù)區(qū)建設(shè)和管理，促進(jìn)黔東南州生態(tài)文明發(fā)展，經(jīng)黔東南州委、州政府與從江縣委、政府和榕江縣委、政府共同研究，同意從江月亮山自然保護(hù)區(qū)和榕江月亮山自然保護(hù)區(qū)合并申請升級為貴州月亮山省級自然保護(hù)區(qū)。為此，榕江縣政府、從江縣政府于2014年9月聯(lián)合委托貴州省林業(yè)廳組織，由貴州省林業(yè)科學(xué)研究院牽頭，邀請了貴州大學(xué)、貴州師范大學(xué)、貴州科學(xué)院、貴陽學(xué)院、貴州梵凈山國家級自然保護(hù)區(qū)、貴州茂蘭國家級自然保護(hù)區(qū)等十多個單位的植物、動物、生態(tài)、地質(zhì)、土壤、氣象、社會經(jīng)濟(jì)、自然保護(hù)等有關(guān)學(xué)科的專家學(xué)者，組成貴州月亮山自然保護(hù)區(qū)科學(xué)考察團(tuán)，圍繞榕江縣、從江縣擬建保護(hù)區(qū)及周邊相關(guān)地區(qū)約50000 h㎡范圍，開展深入的多學(xué)科綜合科學(xué)考察工作，并據(jù)此提供自然保護(hù)區(qū)建設(shè)、發(fā)展的決策依據(jù)。
        據(jù)考察，保護(hù)區(qū)淡水藻類共包括6門9綱17目31科63種（屬）：藍(lán)藻門為1綱、3目、7科、14種（屬），甲藻門為1綱、1目、1科、1種（屬），裸藻門為1綱、1目、1科、1種（屬），隱藻門為1綱、1科、1種（屬），硅藻門為2綱、5目、9科、20種（屬），綠藻門為3綱、6目、12科、26種（屬）；保護(hù)區(qū)大型真菌種類共有235種和變種，其中子囊菌20種，隸屬于5科、11屬、擔(dān)子菌215種，隸屬于40科、86屬；苔蘚植物374種，其中蘚類植物包括39個科，100個屬，224種，苔類植物包括30個科，47個屬，150種；有石松類和蕨類植物25科78屬194種（含種以下分類單位），區(qū)境內(nèi)石松類及蕨類植物資源豐富，系統(tǒng)進(jìn)化完善；有草本種子植物569種，隸屬78科317屬。其中，假繁縷（Theligonum macranthum）和三脈兔兒風(fēng)（Ainsliaea trinervis）為貴州首次記錄種；有木本種子植物766種，隸屬101科295屬。其中，裸子植物（針葉類）6科9屬14種，被子植物（闊葉類）有95科286屬752種。
        月亮山保護(hù)區(qū)內(nèi)有軟體動物28種，隸屬于13科21屬；倍足動物4種，隸屬于4科4屬；環(huán)節(jié)動物22種，隸屬于8科15屬；甲殼動物7種，隸屬于6科7屬，發(fā)現(xiàn)一個新種，即榕江米蝦Caridina rongjiangensis Chen et al, 2016。有蜘蛛目動物43種，隸屬于13科33屬。其中有2個新種，即鐮刀龍隙蛛Draconarius drepanoides Jiang & Chen, 2015和李氏貝爾蛛Belisana Lii Chen et al, 2016。有魚類57種，隸屬于4目14科44屬，占貴州魚類總種數(shù)的28.2%。兩棲動物2目9科22屬28種；有48種爬行動物，隸屬于3目10科34種，類群數(shù)量較為豐富；有鳥類176種，隸屬于15目48科。其中紫背葦[開鳥] （Ixobrychus eurhythmus）為貴州省鳥類新記錄；有獸類共51種，隸屬8目22科42屬，約占貴州哺乳動物總數(shù)（142種）的35.92%。